依加值型及非加值型營業稅法（下稱營業稅法）第5條及第6條之1規定，保稅區是指政府核定的加工出口區、科學工業園區、農業科技園區或自由貿易港區，以及海關管理的保稅工廠、保稅倉庫、物流中心或其他經目的事業主管機關核准設立且由海關監管的專區。
保稅區營業人把保稅貨物自國外進入上述專區，都不會視為進口，而不用課徵營業稅。但若保稅區營業人將保稅貨物自保稅區進入中華民國境內的其他應稅地區，應屬進口貨物，除符合營業稅法第9條規定免徵營業稅外，須由海關代徵應徵收的營業稅。
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